Netpeak Spider — бесплатная программа для постраничного анализа сайта. Выдает очень много полезной информации по каждой странице сайта: коды ответов, наличие атрибута rel=»canonical», дубли метатегов, количество H1 заголовков, количество внутренних страниц и другая информация. Вот пример работы программы:
Спойлер (нажмите чтобы показать/скрыть)
Site-Auditor — бесплатная программа для экспресс анализа сайта. Надо отметить, что данным софтом я давно перестал пользоваться ввиду того, что для быстрого анализа можно использовать онлайн-сервисы — мне так гораздо удобнее, а для полного анализа программа не дает достаточно данных. Однако, многие оптимизаторы предпочитают использовать десктопные программы. Что же, смотрите сами, что вам больше по душе.
Спойлер (нажмите чтобы показать/скрыть)
Xenu’s Link Sleuth — бесплатная программа для поиска битых и исходящих ссылок. Данный софт настолько полезен и уникален, что аналогов просто нет, насколько мне известно. Xenu’s Link Sleuth на английском языке, но вы можете скачать версию с русификатором, которую использую я. Под спойлером ниже — скриншот программы во время работы 
Спойлер (нажмите чтобы показать/скрыть)
Screaming Frog SEO Spider — еще одна программа (платная ) для постраничного анализа сайта. Отличий от Netpeak Spider достаточно много, функционал программы огромный. Например, из того, что использую лично я и чего нет в Netpeak: количество H2 заголовков и их длина, количество слов на странице, использование web-технологий (Flash, JS, HTML) и много других функций. Сразу скажу, что программа окажется бесполезной для абсолютного новичка в SEO, однако для специалиста, который занимается анализами сайтов она — инструмент первой необходимости.
Спойлер (нажмите чтобы показать/скрыть)
Linkoscop — платная программа для анализа внутренней перелинковки. Я использую программу для проверки корректности распределения внутреннего веса, при проведении аудитов или внутренней оптимизации сайтов. Всего в Линкоскопе более 110 инструментов, подробнее про них вы можете почитать на официальном сайте. 
Спойлер (нажмите чтобы показать/скрыть)
Website Auditor от SEO PowerSuite — замечательная программа (платная) для SEO анализа сайтов. Заточена программа под Google, поэтому результаты выдает соответствующие. Однако, программа прекрасно подойдет даже для неопытного оптимизатора, так как в ней указываются явные ошибки и подробные рекомендации по их исправлению. Подробнее про Website Auditor можно прочитать в данной статье. 
Спойлер (нажмите чтобы показать/скрыть)
Majento «PositionMeter» — бесплатная программа для мониторинга позиций сайта. Позволяет проверять позиции, их частотность, релевантные страницы и другую информацию. Можно использовать сервисы антикапчи и XML-лимиты Яндекса.Программа, как для бесплатного софта, очень неплохая, но все же, часто дает сбои, так что рекомендую важные ключи дублировать в онлайн-сервис или платный софт, как SERP Parser, например.

Инструменты для анализа сайта

Одни из основных инструментов для анализа сайта, которые мы используем в работе – это Google Webmasters Tools и Яндекс Вебмастер. Сервисы помогают обнаружить многие технические ошибки на сайтах и во время их устранить. Большая часть функций пересекается, но есть и уникальные.

Google Webmasters Tools

1. Сообщения об ошибках сайте

После выбора сайта мы получаем информацию об ошибках с описанием и рекомендуемыми действиями:

gwt-1

2. Проверка наличия дубликатов страниц и страниц, содержащих повторяющиеся метаописания

Зачастую дубликаты страниц имеют одинаковые теги Title и метатеги Description. В разделе Вид поиска -> Оптимизация HTML можно обнаружить страницы с повторяющимися метаданными:

gwt-2

3. Проверка на наличие санкций

В этом разделе можно получить информацию о наличии ручных санкций со стороны поисковой системы Google. Санкции могут быть наложены по разным причинам – искусственные ссылки на сайт, скрытый текст, избыточное количество ключевых слов, некачественный контент, спам и другие причины.

SEO инструменты нужны каждому специалисту, который серьезно занимается продвижением сайтов. Они облегчают работу, сокращая время рутинных процессов. Благо сейчас индустрия продвижения развита хорошо и на рынке представлено множество полезных seo сервисов.

Список ниже будет «напоминалкой» как для seo-специалистов, так и для владельцев агентств, которые должны быть в курсе какие инструменты нужны вашим подчиненным для эффективной работы. Ведь часто даже в крупных компаниях, предоставляющих услуги продвижения, не покупают необходимые seo инструменты для анализа сайтов клиентов.

Этот перечень будет дополняться и изменяться, чтобы перечислить все значимые инструменты для seo-специалиста. Потому сохраните ссылку на материал и сверяйтесь с ним регулярно.